华支睾吸虫病的临床表现与寄生的虫数及患者的机能状态有关。潜伏期1-2个月。轻度感染时不出现临床症状或无明显的临床症状。重度感染时，在急性期主要表现为过敏反应和消化道不适，包括发热、胃痛、腹胀、食欲减退、四肢无力、肝区痛、嗜酸性粒细胞明显增多等，但大部分患者急性期症状不很明显。临床上见到的病例多表现为慢性症状，患者的症状往往经过几年才逐渐出现，一般以消化系统的症状为主，疲乏、上腹不适、食欲减退、厌油腻、消化不良、腹痛、腹泻、肝区隐痛、头晕等较为常见。常见的体征有肝肿大，多在左叶，质软，有轻度压痛，脾肿大较少见。严重感染者伴有头晕、消瘦、水肿和贫血等，在晚期可造成肝硬化、腹水、胆管癌，甚至死亡。儿童和青少年感染华支睾吸虫后，临床表现往往较重，除消化道症状外，常有营养不良、贫血、低蛋白血症、水肿、肝肿大和发育障碍，以致肝硬化，极少数患者甚至可致侏儒症。