1. 控制传染源 治疗病人和感染者。治疗药物目前应用最多的吡喹酮与阿苯达唑。家养的猫、狗如粪便检查阳性者应给予治疗。根据近年全国华支睾吸虫病综合防治示范区的防治经验，在重感染地区（感染率超过40%），应全民服药；感染率低于20%的地区，对重点人群进行防治，措施均为每年服药1次，经过连续3年的防治，可取得很好的防治效果。
2. 切断传播途径 加强粪便管理，不让未经无害化处理的粪便进入鱼塘。结合农业生产清理塘泥或进行药物灭螺，对控制本病也有一定的作用。本病是由于生食或半生食含有囊蚴的淡水鱼、虾所致，预防应抓住经口传染这一环节，防止食入活囊蚴是防治本病的关键。
3. 保护易感人群 做好宣传教育，使群众了解本病的危害性及其传播途径，自觉不吃生的及未煮熟的鱼肉或虾，改进烹调方式和饮食习惯，注意生、熟食的厨具要分开使用。不要用未经煮熟的鱼、虾喂猫等动物，以免引起感染。随着淡水养殖业迅速发展，还应加强鱼类等食品的卫生检疫工作。
