华支睾吸虫的传播有赖于粪便中的虫卵有机会入水，而水中存在第一、第二中间宿主以及当地人群有生吃或半生吃淡水鱼虾的习惯。作为华支睾吸虫第一中间宿主的淡水螺可归为4科6属12个种，最常见的有：纹沼螺、赤豆螺（傅氏豆螺）、长角涵螺。这些螺均为坑塘、沟渠中的小型螺类，适应能力强。各种螺感染华支睾吸虫的程度各地报道不相同，而且感染率随季节变化。在螺体内，华支睾吸虫一般只发育至尾蚴阶段。但也有报道华支睾吸虫在螺体内能发育称为囊蚴，这可能是尾蚴成熟后因环境变迁，螺不能在水中生活，尾蚴不能逸出，而进一步发育为囊蚴。

华支睾吸虫对第二中间宿主的选择性不强，我国已证实的淡水鱼宿主有15科57属101种。但从流行病学角度看，起传播作用的主要是常规的经济鱼类和常见的野生鱼类。养殖的淡水鲤科鱼类，如草鱼、青鱼、鲢鱼、鳙鱼、鲮鱼、鲤鱼、鳊鱼和鲫鱼等特别重要，是居民最常食用的鱼类。囊蚴可分布在鱼体的各部位，如肌肉、皮、头、鳃、鳍及鳞等，一般以鱼肌肉最多，尤其在鱼体中部的背部和尾部较多。因鱼的种属不同，囊蚴的分布亦可不同。除淡水鱼外，淡水虾如细足米虾、巨掌沼虾、中华长臂虾和鳌虾等也可有囊蚴寄生。