碘缺乏病是世界上分布最广、受威胁人口最多的一种疾病，分布于全球碘缺乏的地理环境。著名的碘缺乏病流行区是亚洲的喜马拉雅山区、欧洲的阿尔卑斯和比里牛斯山区、南美的安第斯山区、非洲的刚果河流域、大洋洲的巴布亚新几内亚、北美洲的五大湖盆地。全球共有22亿人口（占全世界人口的38%）生活在缺碘地区。

我国是世界上碘缺乏病分布广大、病情严重的国家之一。除上海市外，全国30个省、市、自治区和新疆生产建设兵团都有流行。估计在建国初期全国地甲肿患者人数可达2000万人。

碘缺乏病病区分布与地理位置和地形地貌关系密切，在一些山区、半山区、丘陵、河谷地带以及河流冲刷地区缺碘较为严重。我国碘缺乏病病区主要分布为：在东北有黑龙江省的三江平原地区，大、小兴安岭山区，吉林上百山区，在华北有河北省的燕山山区，内蒙古南部的山区，河北与山西交界的太行山区，山西的吕梁山区；在西北有陕西省的秦岭山区，甘肃的陇南山区，宁夏的六盘山区，青海东北部的农业区，新疆塔里木盆地周围的农业区，天山北麓部分地区；在西南有四川东北部大巴山区与西南部大小凉山地区，云南西部的德宏地区，贵州东部、东南部与西南部的山区，西藏喜马拉雅山北麓雅鲁藏布江河谷地区，在中南有广西西部与西北部的山区，广州北部山区，湖北的大别山与仙霞岭，福建的武夷山区，山东的沂蒙山区。