一、 诊断依据
1、流行病学资料 疫区居民或在疫区居留过的非流行区人员（应有充分的克氏锥虫接触史。通常疫区旅行并不说明充分接触克氏锥虫，而输注慢性恰加斯病患者的血液或接受其器官，可认为是充分暴露）。
2、临床症状
2.1发热，厌食，淋巴结炎，轻度肝脾肿大，心肌炎，局部出现炎症性结节称为恰加斯肿。
2.2 心悸，心肌肥大等。巨食管，巨结肠，消瘦等。
3、实验室检查
3.1 显微镜检查 抗凝血查见活动锥鞭毛体，或制厚、薄血涂片，姬姆萨染色后观察到锥虫。（适合急性期诊断）
3.2 免疫学检测
3.2.1 ELISA法（参见"Chagatest ELISA recombinante v.3.0."试剂盒操作说明）检测阳性。
3.2.2 免疫层析试条法（参见CHAGAS STAT-PAK™试剂盒操作说明）检测阳性。
二、诊断标准
1、疑似病例 符合1和2.1条者为疑似急性期病例；符合1和2.2条者为疑似慢性期病例。
2、临床诊断病例 相应疑似病例并符合3.2条。
3、确诊病例 相应疑似病例并符合3.1条。
三、鉴别诊断
恰加斯心脏病需与高排血量心力衰竭、产后心力衰竭、急性风湿热、心瓣膜病、先天性畸形及急性心肌炎等相鉴别，心电图和超声心动图及查克氏锥虫特异性抗体有助于鉴别；慢性期出现的巨食管需与食管癌相鉴别；巨结肠需与先天性巨结肠等相鉴别。
