一、     显微镜检查  

急性期于外周血抗凝后或血沉棕黄层查活动锥鞭毛体，或制厚、薄血涂片，姬姆萨染色后观察锥虫。

二、     病原分离鉴定  

可用血液接种鼠体或于NNN培养基培养，或用接种诊断法，使人工饲养的未受感染锥蝽饲食受检者血液，4周后查锥蝽肠道内有无锥虫。

三、     免疫学诊断

包括间接荧光抗体技术（IFA）、间接血凝实验（IHA）和ELISA等，有较高的灵敏度。

四、     PCR  

克氏锥虫小环kDNA的可变区及小外元基因可作为PCR检测的有效目标序列。

五、     外周血象  

急性期可见白细胞增多，血沉加快等。

六、     其他检查  

累计心脏时，心电图多见右束支传导阻滞，左前半分支阻滞，A-V延长，T波改变，Q波异常等。X线检查和超声心动可见心脏扩大；累计食管时，钡餐检查可见排空减缓和食管扩张；结肠受累时，钡灌肠可见结肠扩张。